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按測序技術，親子鑒定可以分為三種：

傳統親子鑒定：小孩已經出生，基于一代測序技術進行的STR位點的鑒定，

精準親子鑒定：小孩已經出生，基于一代和二代高通量測序技術進行的STR+SNP位點的鑒定，較第一種更為精準；

孕期親子鑒定（無創親子鑒定）：是指孕婦在孕滿6周后，通過采集靜脈血，基于二代高通量測序技術，檢測胎兒游離DNA即可進行親子關系鑒定。

按檢測用途，親子鑒定分為兩種：

一種是司法類親子鑒定，是具有司法鑒定資質的鑒定機構，依照司法鑒定流程依法受理的一類親子鑒定類案件，此類案件需出具具有法律效力證明文件，因此被稱為司法親子鑒定，如訴訟、上戶口、遺產繼承、出國留學等，要做的都是這一類鑒定。

另一種是家庭隱私親子鑒定，適用于匿名的只希望知道結果的親子鑒定客戶，可以采用匿名郵寄樣本或自采樣郵寄的方法。

司法親子鑒定，對人對樣本對檢測結果都負責，報告具有法律效應。

家庭親子鑒定，只對樣本檢測結果負責，報告不具備法律效應，鑒定所對樣本報告負法律責任。